南洋大学的校徽是一座星和黄、蓝、红三道光圈所组成的图案，这图案的总结构象征了交流、相辉与团结。
从祖先说，华人是黄帝的子孙；从人种说，华人属于黄色人种；因此，黄代表了中华民族，黄的光圈代表了中华文化，那座作为黄的光圈轴心的黄星，便代表了以发扬中华化为职责的南洋大学。
黄、蓝和红三道光圈紧密地连结在一起，象征了星马间华、巫、印三大民族和平共处和文化交流。这是南大校徽第一义。
从教育上说，黄、蓝和红三道光圈象征了仁、智和勇。这是第二义。
从学术研究上说，黄、蓝和红三道光圈象征了天、地和人。这是第三义。
从生活上说，黄、蓝和红三道光圈象征了意志、思想和行动，又象征了学习、工作和健康。这是第四义。
从人格上说，黄、蓝和红三道光圈象征了真、善和美。这是第五义。
从学校本身说，黄、蓝和红三道光圈象征了董、教和学。这是第六义。
从全体师生的期望说，黄、蓝和红三道光圈象征了立德、立言和立功。这是第七义。
三道光圈，成为三位一体；其所象征的七种意义，也应该各有其三位一体性。
此外，整个校徽图案给人以下几种感觉：
第一种感觉是光明、纯正和圆满。光明指星座与三道光圈。纯正指星座与三道光圈采用的最基本的黄、蓝和红三原色，纯而不杂，线条发展均衡，不偏不倚，又为最正确的几何图案。圆满指光之圈。
第二种感觉是自由、平等和博爱。自由指圆转无碍；平等指彼此如一；博爱指亲切相关。
“圆”是轮状，“星”是轴状，因此南大的校徽又象征时代，象征前进，象征自强不息。
三原色加减乘除，可得无数异色。三光圈交相辉映，可放无数异彩。南大的校徽说明了南大纯正的宗旨，也说明了南大的态度，并决心圆满尽其使命自勉。